Футбольный клуб "Кубань" основан в 1928 году при НКВД Краснодара под названием "динамо". Некоторое время также назывался "Нефтяником" и "Спартаком", а своё современное имя обрел в 1963 году. В 1980 году "Кубань" впервые приняла участие в высшей лиге чемпионата СССР, где продержалась 3 сезона: наивысшее достижение – 13 место в 1981 году.
Первый чемпионат России главная футбольная команда Краснодара провела в высшей лиге, откуда с треском вылетела в том же сезоне, после чего целое десятилетие мытарилась по первой-второй лигам. В 2004 году "Кубань" вышла в премьер-лигу и несколько сезонов подряд то вылетала в первый дивизион, то вновь возвращалась в элиту отечественного футбола, получив обидное прозвище "команда-лифт".
В сезоне 2011/12 "Кубань" добилась наивысшего достижения в истории в РФПЛ – 8 место. Лучшее достижение в Кубке России – финал в розыгрыше 2014/15 годов.
Пути "Зенита" и "Кубани" впервые сошлись на групповом этапе Кубка СССР 1980 года:
матч, проходивший в Адлере, завершился вничью со счётом 1-1.
В данное время "Кубань" играет в ФНЛ.